南路自土匪橫行嘉義，道路不通，臣飭署臺灣鎮章高元專壁嘉防，任剿土匪。由該鎮撥派副將周鳴聲率練兵一營屯紮埔裏社，招撫諸番社。疊據周鳴聲及埔裏社通判林桂芬先後稟報：自冬至夏，該處東至後山花蓮港，西抵罩蘭諸番社，經遣派舌人逐社開導，就撫者凡六十餘社，未煩一兵。又據駐紮後山統領副將張兆連稟稱：該軍分防恆春、埤南、花蓮港一帶，地亙數百里，自奉檄撫番開導，諸酋先後就撫，一百七十二社均經薙髮歸順。其在深山未降番社尚多，稟請派兵嘉義，開道直達埤南，兩面夾撫。且稱此路開通，達埤南纔五、六日程，可免自恆春盤繞數百里。臣考地圖，見其所議極是，遂於二月二十八日檄飭駐防安平記名提督楊金龍、署臺灣鎮章高元兩軍，各出七成隊伍，於三月初旬，自嘉義進兵。先期經嘉義知縣羅建祥令墾戶葉陽春馳赴前山大南勢諸番勸諭歸化。羅建祥又親往招撫。所有上下八社社長阿巴里等一千七百餘人，咸薙髮歸化。章高元、楊金龍於三月十八日由後大埔開道設橋梁，招撫未降番社，並用降番二十人作為鄉導。惟師行過雁裏溪、八潼關等處，實屬險阻，入夏之後，溪漲輒經旬不落。八潼既過，兩軍方可與張兆連所部聯絡。臣已諭飭該統領等步步穩慎，妥商辦理，不求近功。此南路冬夏以來開山剿撫之情形也。
臣查臺灣生番，橫亙南北七百餘里，盡佔腹心之地，犬牙錯處，無一不與民地為鄰，歲殺居民至千餘人之多，匪盜藉番地以為巢，聚眾搶劫，土豪藉防番以歛費，養勇抗官，官令不行，民糧紛擾，絕海瘴厲之鄉，官如傳舍，相率苟安，生番殺人，視如未睹。臣忝膺斯土，謬領重兵，紳民訴番兇虐，民生不聊，安忍漠焉恝置？綜覽全臺形勢，如人之一身，生番橫亙胸腹，四肢血脈不通，呼吸不靈，百病叢作。當此強鄰迭伺，一島孤懸，內患不除，何由禦外？故前船政大臣沈葆楨創議開山撫番，識量宏遠，駐臺未久，遽任兩江。臣渡臺以來，即奏請以辦防、清賦、撫番為急務。辦防、清賦，尚易舉行，惟剿撫諸番，官紳輒多疑憚，或謂番情反覆，叛服無常，或謂山險難通，告蕆無日。且歷年開山撫番，虛糜鉅款，久無實效，覆轍何為。臣與前貴州藩司沈應奎、道員林朝棟力排眾論，一意經營，所恃不增一兵，不增一餉，縱無成效，抑復何傷？今幸仰賴天威，半歲之間，招撫四百餘社，薙頭歸化，逾七萬人。前山舊墾田地二萬畝，畏番棄置，灌莽塞途，現已重新墾熟，既可開疆設縣，為國家久大之謀，又可建營分屯，杜民番仇殺之禍，所裨於臺灣全局，實大且深。所〈賸，貝代月〉後山生番，居處零落，約計不過十萬人；現在夏氣炎蒸，內山瘴氣過重，將士多病，未便興師。臣已檄飭於四月底俱回防營休息，秋冬之際，再行分路入山。查光緒元年，沈葆楨派兵剿服獅頭等社，目見將士勞苦，地入窮荒，請將員弁官紳給獎；前督臣何璟派令署提臣孫開華、臺灣鎮吳光亮攻剿後山各番，將士亦請優獎；俱蒙恩准施行。臣於檄調諸將開山之際，即三令五申，不准誑殺焚擄，捏報戰功。實有戰功，或異常勞績，方准請獎。惟林朝棟、劉朝祜兩軍，自冬至夏，披荊斬棘，鑿石開山，顛踣於懸崖煙瘴之中，屢戰於風雨昏茫之際，艱危萬狀，勞苦功高。提督劉朝祜因病假歸，無庸給獎。選用道世襲騎都尉林朝棟、頭品頂戴升用提督陝甘遇缺簡放總兵柳泰和，始終勤奮，艱苦異常，均請賞給勇號。林朝棟並請賞加三品銜。記名簡放總兵彪勇巴圖魯唐仁元，擬請以提督交軍機處記名，遇總兵缺出，先行請旨簡放。記名提督輯勇巴圖魯尤福聚，擬請賞給一品封典。兩江補用參將張廣居，擬請免補參將，以副將仍留原省儘先補用。福建候補典史陸陳謙，擬請以縣丞仍留福建補用。武舉黃希文，擬請以守備補用。六品軍功陳玖英，擬請賞給五品藍翎。其餘出力將士，擬俟全番一律歸化，再行擇尤請獎。
光緒十二年五月初八日奉上諭：劉銘傳奏各路生番歸化請將開山剿撫尤為出力官紳懇恩給獎一摺，上年冬間，臺灣生番滋事，經劉銘傳督飭官軍分路剿辦，並派員赴各社反覆開導，該番等懾於兵威，率眾就撫，現已招撫四百餘社，歸化七萬餘人，辦理尚為妥速；劉銘傳調度有方，深堪嘉尚。劉朝祜、章高元隨同辦理剿撫事宜，頗資得力，該二員均著交部從優議敘。其餘出力員弁官紳，不無微勞足錄，自應量予獎勵。道員林朝棟，著賞給勁勇巴圖魯名號，並加三品銜。總兵柳泰和，著賞給健勇巴圖魯名號。唐仁元著以提督交軍機處記名，並遇有總兵缺出，先行請旨簡放。提督尤福聚，著賞給一品封典。參將張廣居，著免補參將，以副將仍留原省儘先補用。典史陸陳謙，著以縣丞仍留福建補用。武舉黃希文，著以守備補用。軍功陳玖英，著賞給五品藍翎。另片奏前藩司沈應奎贊助撫番，籌畫經費，異常出力，請逾格恩施等語，沈應奎著賞還原銜花翎。餘著照所議辦理。該部知道。欽此。·督兵剿中路叛番並就近巡閱地方摺（十二年九月初二日臺北府發）
竊臣到臺以來，業經兩至澎湖，一赴臺南，惟中路彰化一帶地方，未暇巡閱。本擬俟秋後大甲溪水平再行前往，七月初十日，據道員林朝棟稟稱：六月二十二日，彰屬罩蘭莊墾丁在途突被蘇社兇番殺死四人，毀園寮二座，請兵剿辦。臣當批飭林朝棟往諭該社交兇懲辦，如敢抗違，即會同柳泰和各督所部相機剿辦去後，旋據林朝棟、柳泰和會稟：該社不惟抗不交兇，且勾結馬那邦等六社同背官軍，繳還歸化旗以示決絕，並聚眾馬那邦山戕殺採煎樟腦居民。八月十一日，林朝棟、柳泰和率軍抵罩蘭之大隙山，踰二嶺即為馬那邦社，蘇魯等社在其東南，剿辦蘇魯，必先由馬那邦社經過。林朝棟自山上逼攻，柳泰和自山下以進。馬那邦悍甚，力拒官軍。林朝棟等督兵擊退，抵其巢穴，燒燬番屋二十餘間。十三日，林朝棟等分三路環剿馬那邦社，其酋分途迎敵，眾至千餘，潛伏林箐，扼其隘要。林朝棟等分兵前後夾擊，傷斃兇番十數人，餘眾始遁。是日，棟字營勇陣亡者六人，並鎗傷哨長林榮枝。同日，又據東勢角稟報：分駐埋鶴坪之棟字營後哨，於十二日被兇番二百餘人攻圍甚岌，自辰至午，鎗斃番眾十餘人，始行退去，哨勇死者三人。十五日，林朝棟、柳泰和飭諸勇伐木造橋，進攻蘇魯社。該番埋伏深林，開鎗拒敵，春字營勇陣亡二人，棟字營勇死傷十餘人，經併力奮擊，蘇魯山外番社悉被攻燬，各番乃退聚山中。當接戰時，後路大隙山運糧勇夫十餘人復被截殺；柳泰和督兵回擊，始行退走。是日，移駐大隙山以顧後路糧道。二十日，林朝棟亦移紮大坪，以規蘇魯內社。同日，探知生番潛襲後路，伏兵待之。及午，番眾果出劫運夫。春字副營管帶李惟義率部前驅，與林朝棟前後夾擊，鎗斃生番二十餘人，敗走而去。林朝棟、柳泰和會稟：兩軍分防山海各要隘，地段長遠，調攻番境，軍不及千，兵力過單，不敷剿辦，請增調營勇，以竟全功。
臣查蘇魯、馬那邦各社生番，素稱凶悍，與罩蘭民庶仇殺頻年，經林朝棟招撫歸誠，仍相仇殺，犬羊反覆，良不足言；乃於大兵進山查辦之初，輒敢勾結各社番公然抗拒，殺傷官兵，頑梗不靈，殊難理喻。若徒懷以柔德，烏足以儆其凶頑？且中、南、北三路降番數萬，歸化不久，未盡輸誠，蘇魯叛番不加嚴剿，風聲所播，繼叛必多，番事何由大定？此次嚴示兵威，妥籌剿撫，不獨已降之番不敢生心再叛，未降之眾亦易就我範圍。臣於本月初三日，自臺北啟行，檄飭駐防澎湖提督吳宏洛四營、駐防滬尾提督朱煥明三營，暫停砲臺工作，各帶六成隊伍，乘輪至鹿港、後壟兩處登岸，馳赴罩蘭，聽候調遣。一俟剿撫事竣，臣即由彰化、新竹沿山一帶，查閱地勢，審定將來建省分治之區，仰副國家經畫巖疆之至意。軍機大臣奉旨：覽奏已悉。該番反覆無常，聚眾抵抗，自宜示以兵威。即著該撫督飭各統領相機進兵，妥為剿撫，務令各番知懼知感，傾忱向化。欽此。
·督兵剿撫中北兩路生番請獎官紳摺（十二年十一月十一日臺北府發）
竊臣於九月初二日，曾將中路生番滋事督兵往剿各情具奏在案。十月十九日，遞回原摺，恭奉諭旨：『覽奏已悉，該番反覆無常，聚眾抵抗，自宜示以兵威。即著該撫督飭各統領相機進兵，妥為剿撫，務令各番知懼知感，傾忱向化。欽此』。仰見廟謨宏遠，指示周詳，於德威並用之中，寓剿撫兼施之意。跪誦之下，欽佩莫名。
臣於九月初十日行抵彰化之罩蘭。提督吳宏洛澎湖四營、提督朱煥明滬尾三營，各帶六成隊伍，乘輪登岸。林朝棟所帶土勇，駐大隙山巔，逼近番社，後路隔絕，糧道不通，勢甚危迫。臣於十三日先帶親兵百人至大坪一帶察勘地勢。查由罩蘭至蘇魯諸社三十餘里，高山峻嶺；柳泰和所開之路，紮營於深林茂草之中，地勢低窪，兇番日事抄劫，先後被殺勇夫七、八十人，平日營伍廢弛，督隊不力，當予撤退，另派記名提督李定明接統其軍，改由甕子肚開路至大隙山頂。十七日，朱煥明會同林朝棟添僱民夫開通山道。臣於十五日移紮大坪。十六日，令吳宏洛率部進紮白布棚山頂，由房裡溪邊前進。十七日，臣由大坪進紮大隙山，攀藤附葛，逾嶺數重，半係陡壁懸崖，林深箐密，伏番暗鎗狙擊，均經各營擊退。是日，林朝棟、朱煥明亦各率所部進紮溪底，直逼蘇魯、馬那邦兩社之中。臣到大隙山後，見山勢險峻，糧道奇艱，兇番日劫後路，急須開通房裏溪徑道，以便運糧；當夜飛飭吳宏洛由白布棚繞溪而進，並飭兼理彰化縣蔡嘉榖挑選屯丁民夫，開路搭橋，復飭化番老屋峨社番目白眉峰為鄉導，調李定明新統春字三營隨臣下山。十八日，由大隙山移紮溪邊。吳宏洛親帶小隊，自溪底渡河，鳧水而進。蘇魯番見官軍逼近，隔溪開鎗，擊傷兵勇數人。林朝棟、李定明當即出隊，鳧水過溪，攻擊蘇魯番。該社番狡甚，緊扼山口，修築石卡，遍佈竹籤，併力死拒。林朝棟率勇由左而入，李定明自山邊進攻。該番鎗法精嚴，發必命中，兩軍傷亡五十餘人。奮勇直前，連破雪山坑番卡二座，李定明面中三創。時已曛黑，乃飭收軍。十九日，臣移紮老屋峨山巔，令朱煥明於蘇魯對面山巔築營安砲。二十日，飭朱煥明、林朝棟各派百人，攜沙袋進紮雪山坑，以扼武榮社救援蘇魯之路。二十二日，令各軍分三路進攻蘇魯社。春字副營營官李惟義先率三營攻番石壘，吳宏洛一軍由溪東堵擊馬那邦等社援師，林朝棟自雪山坑堵擊武榮社援眾。蘇魯番恃有石壘，死拒不休。我軍自山頭迭施炸砲，轟擊番卡。李惟義率軍鼓勇而上，立破蘇魯社石營，奪獲刀鎗多件，燒燬番屋數處。各番越嶺而逃。馬那邦、武榮等社屢致死來援，經吳宏洛、林朝棟兩軍擊退。營勇傷亡四十餘人，陣亡哨官一員。蘇魯既克，番眾無家，乃聚屯於出火山。其山三面陟絕，惟後路可登。該處為司馬限等七社出入要道，諸番壘石死拒，必攻破此山，絕七社之聲援，方克制其死命。
查武榮、司馬限等七社悍番，不足七百人，餘皆附近各社裹糧暗助。臣當飭化番白眉峰召近地大小南勢十餘社番長至營，剴切曉諭，賜以酒食，不准幫助叛番。各番長皆指天自誓，願奉約束。司馬限等社勢益孤單，惟死守出火山，不敢攻劫後路。二十五日，吳宏洛軍至，即令會同林朝棟自東凍山繞出火山後襲之。黎明時，吳宏洛乘霧以進，連破凍山巔番卡二處。林朝棟下山，攻破一碉，隨即滾營前紮。二十九日，連破碉卡七所，齊抵出火山口。諸番就山腰壘石為長牆一道，兩面深林茂草，處處埋伏。吳宏洛、林朝棟各率所部仰攻三日，死傷弁勇百餘人。該番負嵎死拒，未能攻破。十月初二日，臣派李惟義等開路逼山腰，分其兵勢。復調署臺灣鎮總兵章高元三營，自彰化集集街前來助剿。初三日，吳宏洛、林朝棟帕首當先，誓以必克。猛攻出火山腰長牆，用炸砲火箭燒殺林內伏番，諸勇乘勢一鼓而登，斃番甚眾，餘皆滾崖而逃。
臣登山，觀其山狀類馬鞍，約長五里。吳宏洛等奪據東巔，番復死守西面，中隔深澗，惟山脊一線可通，番築石碉五座，復圖死拒。吳宏洛自山脊鼓勇馳進，林朝棟亦自山邊並進。初五日，李定明又裹瘡督戰，進攻山腰。三軍會合，於初六日破碉三座，造橋涉深澗，群番猶聚山頂死守石營。初七日，章高元率副將萬國本一營並砲軍先到。初八日，自西面合攻。萬國本等破碉二座，遂將出火山三面合圍。初九日，章高元所部全到，乃令吳宏洛等四面環攻。營官鍾玉鏞率隊先登，鎗傷陣亡。自辰至午，弁勇受竹籤傷者百餘人。該番死守不退。鎮海營營官提督萬本華率奮勇六十人蛇伏深林密草中，瞰竹籤稀處進逼石牆，舞纛大呼，各勇皆踰牆競入，鎗斃兇番百餘人。出火山石營立拔。初十日，蘇魯等七社番長哭求化番白眉峰代為乞降。臣見兵威已立，當即允許。十二日，七社番長到營，誓天歸化，不敢再背天朝。誓畢仍泣，言居民欺虐情狀，官抑不伸，發憤報仇，竟罹此禍。臣念民番皆朝廷赤子，既經悔過，心實惻然。當將罩蘭撫墾委員撤換，另派熟悉番情者代之；清結民番積欠，以息紛爭；並令林朝棟劃明地界，謹遵聖諭，務令各番知懼知感，免致再肇兵端，仰副朝廷一視同仁之至意。臣於十三日振旅返罩蘭，令章高元還集集街，仍闢後山水尾之道。