奏为嘉义粤勇溃散，请将贻误之护提督革职拏问，并请速敕林文察办理台湾军务；恭折仰祈圣鉴事。
窃自台匪倡乱以来，即经奏调护理福建水师提督吴鸿源、总兵曾玉明、副将曾元福各带兵勇赴台剿办；而吴鸿源原统水陆兵勇三千余名，嗣在台湾又添募广勇屯丁二千一百名，兵力不为不厚。乃自嘉义解围之后，并不迅图攻剿，顿兵南靖庄、二重沟者数月，致逆匪得预为准备竹围、炮柜，既难力攻，自应坚筑营垒，留兵与贼相持；而分兵别觅间道，相机雕剿，以孤贼势。乃仍袭攻坚之策，日以出队攻扑为事；师老，而贼益无所惮。致五月二十七日攻扑南靖庄之粤勇一千名，藉词口粮久欠，哗然溃散；其时贼匪乘机攻扑，各营兵丁亦多伤亡逃逸。嘉义一带贼氛猖獗、道路梗阻，虽据道、府禀：吴鸿源以力攻南靖庄不下，忧愤成疾，致有此挫；然始则迁延不进、继则调度乖方，实难辞咎。相应请旨将护水师提督吴鸿源革职拿问，以昭儆戒。
臣维台湾一郡远隔重洋，居民多系泉、漳及广东占籍。每村辄筑土围，栽植篥竹，日久根株盘亘，有碉堡之固而无修筑之劳；枪炮弹丸不能飞入，纵火不能延烧。地脉肥饶，擅山海之利；以故恃险、恃富，易肇乱萌。从前平台之役，往往克期蒇事；盖及其初起，急与芟夷，故民志定而贼势孤也。兹则官军相持已久，锐气潜消；又远隔重洋，饷需难以按期接济，逆贼反得负固而乘其敝。臣查署陆路提督林文察籍隶台湾内山，尚称能战；其弟林文明上年从军告假回台，亦称勇敢。该署提督前闻台湾之变，会请回籍练团助剿。合无仰恳天恩，即令该暑提督酌带本标得力弁兵数百名渡台，号召旧部；并统领各军克期攻剿，以靖海疆。其林文察未抵台之先，令其先饬林文明预将旧部挑选以待，庶期一鼓作气，克利戎机。臣非敢谓平台非林文察不可，特以昔时用客兵，而今则不能不藉土人之力；以贼势蔓延既久，非初起之寇可比也。既用土人，则不能不用巨绅管带；取其性情相习，易于联络招抚也。林文察由实缺总兵署提督，令其统领各军，事权归一；又师行其乡，地势人情皆所熟悉，似于局势为宜。至闽省饷需近为浙省所累，时有拮据之虞；臣当饬福建藩司将援浙饷项内酌拨若干，暂资台饷，发交台湾道支给。
愚昧之见，是否有当？谨会同福建巡抚臣徐宗干恭折具奏，伏乞皇上圣鉴训示施行。谨奏。
同治二年八月十五日，内阁奉上谕：『左宗棠奏「请将贻误之护提督革职拿问」一折，护理福建水师提督吴鸿源经左宗棠调赴台湾剿匪，统带兵勇数千余名，自嘉义解围后，并不迅图攻剿；顿兵南靖庄时逾数月，糜饷老师五月二十七日所部广东勇丁一千名籍词积欠口粮，登时哗溃。致逆匪得以乘机扑营，兵勇亦有伤亡；实属迁延贻误，调度乖方！吴鸿源着即革职拿问，交左宗棠确讯各情从严参办。并着左宗棠督饬林文察等军克期进剿，将台湾府属南靖庄等处踞匪悉数歼除，以靖海疆。钦此』。
议政王军机大臣字寄：同治二年八月十五日，奉上谕：『左宗棠「奏浙师援江获胜，江西肃清，筹办石太股匪；并台湾粤勇溃散，请敕林文察办理该处军务及见办延平、顺昌土匪」各折片，本日巳明降谕旨：将护水师提督吴鸿源革职拿问、护参将吴连升革职留营效力矣。台湾匪徒滋事日久，吴鸿源所统兵勇数已不少，不能于嘉义解围以后，迅图攻剿；辄于南靖庄等处顿兵数月，致该匪得预为准备。迨贼守御即坚，又不知分兵别觅间道相机雕剿，以致师老财匮，勇丁哗溃，贼氛益肆猖獗，实属调度乖方；业经明降谕旨：将该员革职拿问，仍着左宗棠、徐宗干确切查明，如有别项贻误情形，仍据实奏明参办，毋稍徇隐。林文察既籍隶台湾，熟悉情形，即着该署提督拣调得力将士，渡台联络绅团，速将该处匪徒歼灭；并着左宗棠、徐宗干催令林文察赶紧起程，毋稍延误。应需饷项，即饬福建藩司于援浙饷内酌量拨给。延平、顺昌土匪仅数百人，剿捕兵勇不下数千，该统兵官任其回窜星桥老巢，蔓延永安、连城、邵武、归化等处，一味迁延，不遵调遣；业经左宗棠将吴连升等分别咨参惩办，守备张连飞着于提省后严行讯办，按律定拟。并责成曾宪德督率各军将延、汀等处土匪克期歼除，不准再事稽延，致干重咎。江西全境肃清，巳据沈葆桢、曾国藩先后奏报；左宗棠见奏情形，与曾国藩等所奏大略相同。此股贼匪非复窜江西，即回趋广德；前经迭谕曾国藩、沈葆桢饬令江忠义等诸军乘胜进规池、太，并谕左宗棠饬令刘典督率各营由徽境之羊栈岭驰往会剿。此时江忠义等诸军定可追贼入皖，着左宗棠仍遵前旨办理；务令徽郡各营与江忠义诸军联络声势，前截后追，将池、太股匪就地歼除，毋任蔓延旁窜，是为至要！沪军见巳攻克江阴、苏州、嘉兴等城，攻剿正在吃紧，贼势渐蹙；左宗棠当檄令蒋益澧等军攻贼要害，使贼兼顾不遑，当更有一、二处可以得手。将此由六百里各谕令知之。钦此』。
——见左文襄公全集「奏稿」卷六
请以吴大廷调补台湾道缺折（同治五年九月初八日会福建巡抚徐宗干衔）
奏为遵旨拣员调补台湾道缺，仰祈圣鉴事。
窃臣等接准吏部咨开：同治五年五月初十日，内阁奉上谕：『福建台湾道员缺紧要，着该督、抚于通省道员内拣员调补；所遗员缺，着海钟补授。钦此』。窃维台郡孤悬海外，民番杂处，素称难治；近自匪徒迭扰以来，民气嚣然不靖，吏治、军政尤须及时切实经理，乃可长治久安。而地隔大洋，官斯土者，辄借口风汛靡常，遇有禀白事件，任意积压；往往经年累月，匿不上陈。省郡声息隔阂，难于访察。台湾道例加按察使衔并兼学政，专治一方，事权较重；非操守清严、学识闳伟兼具应变之才者，难胜其任。臣等于实任各道员内详加遴选，非初膺外任，即人地非宜。惟盐法道吴大廷，湖南举人；由内阁中书，经臣宗棠奏调军营差遣。前湖北抚臣李续宜奏留湖北、前安徽抚臣唐训方奏留安徽；时已积功，保记名道员矣。臣宗棠由浙入闽时，复调其来闽，奏署福建盐法道；旋蒙恩简放是缺。该员守洁、才长，兼通方略；为臣等所素知。台湾道为海外要缺，惟该道可期胜任。谨合词恭折奏陈，如蒙俞允该员以实缺道员调补，应请免其送部引见。见在丁曰健因病奏请开缺，台湾地方紧要；臣等一面具奏，一面即檄饬吴大廷前往接署。合并陈明。伏乞皇太后、皇上圣鉴训示。谨奏。