上謂『國家元氣之削，由於靖難』；命禮臣追復建文年號，立忠臣方孝孺祠；設姚廣孝像，跪於階前。
六月，鄉試。福省舊額中式一百十七名，特旨廣七十名。錢邦■〈艹已〉請一榜盡賜登科，以成曠典；繼因御史劉霖懋言，下第者俱聽覆試而已。
鄭鴻逵久駐關外，未嘗展一步。有傳北兵至者，鴻逵徒跣疾行三日夜而抵浦城；詢及後至者，則兵譁也。事聞，上削其封爵。鄭芝龍為洪承疇所紿，啖以閩粵王爵；凡關隘、水陸之兵，自二月間俱已撤回。浙東既潰，北師入閩，如入無人之境；守浦城御史鄭為虹、科臣黃大鵬死之。
七月，上生子；大赦覃恩，諸臣悉加封爵。御史錢邦■〈艹已〉力言不可，不聽。
二十五日，上御朝。據關上主事搜得閩中出關迎降書二百餘封，命悉焚之。諭諸臣改心易慮。
八月，仙霞關警報至。上即於二十一日啟行；上與中營皆騎馬，猶載書十餘扛以從。二十七日，出奔汀州。有十餘騎叩城，曰扈蹕者；開門納之，則追騎也，遂執上與曾后。后至九龍潭投水死，上崩於福京。或曰建寧代死者為唐王聿釗，汀州代死者為張致遠；上實未死（楊陸榮「紀事」言：帝與曾妃駢斬汀州城下）。其從死之臣：賴垓（戊辰進士，國子監祭酒）、熊緯（河南丙子解元、癸未進士；由行人陞給事中。從駕被獲於行宮，大罵而死）。其後朱成功屯兵鼓浪嶼，有遣使存問諸臣，云『為僧於五指山』；然亦莫別其真偽也。粵中立國，上尊號曰思文皇帝（又稱紹宗襄皇帝）。
史臣曰：帝英才大略，不能鬱鬱安於無事。在藩服之時，已思撥亂世而反之正；及其遭逢患難，磨勵愈堅。兩京既覆，枕戈泣血，敕斷葷酒；後宮不滿三十人，半系老嫗，於世之嗜好淡如也。性喜文辭，手撰三詔，見者無不流涕感動；御製祖訓後序、行在縉紳便覽序，皆曲雅可誦。所至訪求書籍，親征亦載書數十乘。故太祖命名詩，於唐王位下有「嘉歷協圖銘」之句；不可謂非天生之令主也。論者徒見不能出閩，遂言好作聰明，自為張大，無帝王之度；此以成敗而論也。夫鄭氏以盜賊之智，習海島無君之俗，據有全閩，始願已不及此；既無鞠躬盡瘁之忠，難責以席捲天下之志；謀國、謀身，兩者俱乖，不亦宜乎？帝之托於鄭氏，所謂「祭則寡人」而已。其一、二心膂之臣所藉以經營恢復者，如黃道周、蘇觀生皆有儒者氣象，未嘗非諸葛之亞也；而束縳其手足，使之不能一展所長。蛟龍受制於螻蟻，可責其雷雨之功哉！向使蜀漢有竊命之雄，諸葛不能發其一甲、轉其斗粟，則雖欲成三分之業，亦豈可得？故帝之亡，天也、勢也！。