辛卯，永曆五年春正月己卯朔，上在南寧。二月，柳州破，上移駐田州。三月，使編修劉■〈艹洍〉封孫可望為冀王，至平越不得入。夏四月戊午，皇太后王氏崩於田州。五月，葬於南寧楊美山。上尊謚曰「孝敬、莊翼、康聖皇后」。可望以不允秦封，使賀九儀、張勝、張明志等將兵入衛，賊殺大學士嚴起恆、兵部尚書楊鼐和及給事中劉堯珍、吳霖、張載述等，皆主不予秦封者也。於是，始真封可望為秦王。八月，贈瞿式耜吳國公、張同敞江陵伯。九月，陳邦傅誘殺宣國公焦璉，叛降於定南王。上聞潯州破，駕發南寧。十月辛卯，駕次新寧。上生母馬太妃徽號曰「昭聖、仁壽皇太后」，冊慈煊為太子。十二月甲辰朔，大清兵破濱州。庚午，南寧破。趙印選、胡一青以敗卒同馬吉翔抵桂灘，請上棄舟從陸，盡焚龍舟重器而行。由土司安平、壯雷、歸順、歸朝，一路進發，諸蠻各供糧餉並從官夫役。孫可望既受秦封，乃遣其將狄三品、陳國能、高文貴等以兵三千來迎，並書致從官曰：南寧不守，當駐安隆。從之。是時，可望已據有川東西矣。
壬辰，永曆六年春正月癸酉朔，上在歸朝司留九日，發。戊子，至廣南府。孫可望遣總兵王愛秀表請居安隆。二月戊申，上至安隆，改名安龍府。可望歲以銀八千兩、米六百石上供，從官取給焉。大清兵入四川，可望守將白文選走回雲南。定南王自廣西以七百騎出河池州向黔，大軍駐柳州。可望乃使李定國與馮雙禮等圖桂林，步騎八萬人；劉文秀等圖成都，步騎五萬人。疏聞安隆，封定國西寧王、文秀南康王，餘各加公、侯，從可望請也。三月壬申朔，建行太廟。五月，定國等進攻靖、沅、武岡皆下，疾趨廣西。七月癸酉，遂克桂林；定南王自焚死，獲陳邦傅並其子魯禹，送貴州伏誅。杜永和以瓊州北降；南陽侯李元胤及其弟安肅伯李建捷見執，不屈被殺。劉文秀等陷敘州、重慶，大清兵出擊，大破之，全軍俱沒。九月，李定國北取衡州；孫可望亦自至沅州，攻辰州府，陷之。十一月辛未，大清兵遇定國於衡州城下，大戰竟日，定國不能支，遂敗走。會主帥遇伏殞，定國得收兵，退屯武岡。是年，凡宗藩在貴州者，可望漸殺之。
癸巳，永曆七年春正月戊辰朔，上在安隆府。李定國自桂林勝後，不復受可望約束；可望惡之，使人召赴沅議事，將殺之。定國辭不行，徑回廣西，可望自追之。大清兵進寶慶，與可望戰於花子街，殺傷相當；可望急退，諸營遂潰。大清兵亦不進，各引還，以武慶之間為界。上在安隆，日益窮促，聞定國得廣西，且與可望有隙，乃與內閣吳貞毓等十八人謀召定國入衛；定國感泣，許之以身報。
甲午，永曆八年春正月壬辰朔，上在安隆府。二月，開科取士四十名，以四川熊渭為第一，授庶吉士；餘授知縣、教職有差。可望聞密敕召定國等，三月使部將鄭國、王受彥至安隆，殺與謀十八人；憾定國益甚。定國亦防可望襲之，出師掠廉、雷；夏五月，陷高州，進圍新會。十二月，大清兵至，與尚、耿兩王合擊之，敗北。
乙未，永曆九年春正月丙戌朔，上在安隆府。孫可望遣兵攻常德，復敗歸。上在安龍，塗葦箔以處，日食脫粟。守將承可望意，更相凌逼，挾彈射馬，直入其門；文吏乘輿呵殿過之不復下，改稱府為安籠。歲造開銷銀米冊報可望，稱皇帝一員月支若干、皇后一口月支若干，隱忍延喘而已。李定國既解新會之圍，由高州退守南寧。十二月，孫可望聞其勢不振，遣兵襲之。
丙申，永曆十年春正月丙戌朔，上在安龍。李定國敗可望兵於田州，率兵疾趨安隆，迎帝入滇。可望偵知之，先使白文選至安隆，促上移黔。太后聞之哭，從官亦哭，白文選見之心動，因以情告曰：姑遲行，俟西府至。遂以輿從不集報可望，陰留俟定國數日。定國至，遂奉之西走雲南。可望復使兵邀之，定國已抵曲靖。時，劉文秀守滇，亦素怨可望；聞定國至，即納之。沐天波迎上於馬龍驛。三月，上入雲南，居可望府中，賜李定國晉王冊寶，封劉文秀為蜀王、白文選鞏國公，餘俱為侯、伯。又以定國記室金維新為吏部侍郎兼都御史、龔銘為兵部侍郎，加沐天波柱國少師。馬吉翔復諂附定國，仍以文安侯入閣辦事。遣文選入黔慰可望，可望恨甚；然以妻子在滇，未敢公為逆也。
丁酉，永曆十一年春正月甲辰朔，上在雲南。二月甲申，東宮出閣講學。四月癸酉朔，上聖安皇帝廟號曰「安宗簡皇帝」，后曰「簡皇后」。下詔大赦。五月，使張虎送可望妻子赴黔。可望既無內顧，七月，舉兵反，詔削其王爵。時，可望所部至眾，定國兵不過數千、文秀將留鎮兵亦少，然人心不直可望。兵至交水，其大將白文選、馬進忠、馬惟興、馬寶皆致之，遂大敗走，挈妻子赴長沙降清。論功，封馮雙禮慶陽王、馬進忠漢陽王、馬惟興敘國公、賀九儀廣國公，餘將封侯、伯者十五人。其黨附可望者，程源、鄭逢元等皆降級。十月，遣使間道赴海封成功為延平王。十一月，追贈吳貞毓以下十八人謚蔭有差，遣官諭祭，立廟安隆。
戊戌，永曆十二年春正月戊戌朔，上在雲南。二月，大清兵從蜀、楚、粵三路入黔，李定國使其將劉正國、楊武等守三坡、紅關諸險防蜀，使馬進忠等駐貴州。四月庚寅，劉文秀卒。可望舊將王自奇、關有才反，定國討誅之；內亂平，而貴州已不守矣。是時，蜀兵至三坡，劉正國由水西奔回。晦日，大清兵克遵義，楚兵自鎮遠抵黔，馬進忠等亦走。五月，蜀兵擊敗楊武於開元之流水。七月丙申朔，命李定國為招討大元帥，賜黃鉞。粵兵抵蜀山州。十月，三路兵俱集，信郡王自北至，會於楊老堡，戒期入滇。李定國與馮雙禮等扼雞公背，圖復貴州；別遣白文選將四萬兵守七里關，抵生界次師，示攻遵義，以牽制蜀師。十二月，蜀兵出遵義，由水西以烈趨天生橋，入烏散。白文選懼，棄七里關，走回霑益。泗城洲土官岑繼祿導粵兵入安隆。定國使安仁侯吳子聖禦之，敗績。定國由盤江還師拒戰，連敗於安龍之羅炎、涼水井、撤巖，遂遁回。丁丑報至，上發雲南。
己亥，永曆十三年春正月癸巳朔，上次永平縣。乙未，大清兵入雲南，公侯伯、文武吏多迎降。丙申，上至永昌，下詔罪己。李定國還黃鉞待罪，自稱削秩；不許。二月，白文選敗於玉龍關。初，文選自霑益追及，定國留之斷後。大清兵以二月癸亥出雲南，辛未追敗王國勛兵於普棚，丙子至大理、至玉龍關，文選與張光翠、陳勝等俱戰敗，由沙木和走鎮康，土司總兵呂三桂被殺。永昌聞之，使沐天波、馬吉翔等隨行。己卯至騰越，李定國伏兵潞江之高黎貢山中。大清兵至永昌；辛巳，過潞江。有洩其謀者，定國乃出兵戰竟日，竇名望、王璽皆戰死；定國不能支，復遁。騰越聞報，乘夜走入南甸，平陽侯孫崇雅邀劫資裝於道中。時隨兵尚四千人，夜疾馳迷道，互相驚擾，群臣妻子不相顧，叛卒乘機剽掠，貴人、宮嬪亦失去過半矣。丙戌，抵囊木河，十里即為緬境。沐天波入諭，始啟關，猶勒從官盡棄所攜兵器而後入。晦日，至蠻漠。土官思綿迎入土司城。蠻漠舊為宣撫司，屬永昌府；自萬曆中始為緬有。三月，緬酋以四客舟來迎，從官自覓舟江上，得從者六百四十六人。故氓王子及總兵潘世榮、內監江國泰等九百餘人、馬九百四十餘匹俱由陸，期會於緬甸。己酉，至井亙；緬人禁勿進，遂止其地。李定國既敗於潞江，走孟定，白文選走木邦。已而，文選以兵入緬，緬使人至井亙求檄止兵。文選戰不勝，走回孟良。四月，祁三昇兵至蠻漠，復使丁調鼎、楊生芳往止之。沐天波、蒲英、王啟隆等謀乘間走之戶獵二撤，亦不許。五月甲子，緬復以舟迎。乙丑，發井亙。丁卯，至阿瓦城，距河止焉。此之阿瓦，即緬酋所居城也。戊辰，陸行五、六里，進赭硜；知前陸行者潘世榮等，被緬分給土人為奴，多自殺，惟氓王子八十人後流入暹羅云。緬人於赭硜搆臺以棲車馬，置草屋十間，編竹為城，每日兵士百餘人護之。從官各結茅散處，蠻男婦自來貿易。初至，饋獻頗豐，後漸薄。九月，緬進新稻，命分給從官之窘者。十月戊子朔，頒曆於緬。李定國移居孟良，內有女土官，定國破擒之，遂據其城。十一月，白文選至，與定國合軍。十二月，文選移營猛稟。
庚子，永曆十四年春正月丁巳朔，上在赭硜。三月，李定國部將賀九儀欲出降，定國杖殺之，其卒多潰還雲南。四月，白文選移軍景線。李定國遣使約會兵攻緬，欲迎上，不得，敗緬兵於瑞羊岳。從官資用盡竭，有數日不舉火者；上出皇帝之寶，命吉翔碎之分給，人各數錢。九月，太白經天，凡十有五旬。