可法请分江北为四镇，以黄得功、刘泽清、刘良佐、高杰四人分统之。杰驻徐州，辖徐州及凤阳之怀远、五河、虹、泗州、盱眙、宿州、灵璧、蒙城、亳州十四州县，经理河北、河南开、归等处招讨事；良佐驻寿州，辖凤阳之凤阳、临淮、定远、寿州、霍丘、颍州、颍上、太和、庐州之六安州九州岛县，经理河南陈、许等处招讨事；泽清驻淮安，辖十一州县，经理山东等处招讨事；得功驻庐州，辖庐州之合淝、巢、无为州、滁、和二州、应天之江浦、六合十州县，经理各路援剿事：一切军民皆听统辖，州县有司皆听节制，营卫原本旧兵皆听归并整理，荒芜田土皆听开垦，山泽有利皆听开探。仍许各于境内招商收税，以供军前买马置器之用。每镇额定三万人，岁供本色米二十万、折色银四十万。其体统照山海经理镇、各处提督镇行事。所收中原城池，即归统辖；寰宇恢复，爵为上公，与开国元勋同准世袭。其凤阳旧有总兵官应罢，改副将一员。又言操江旧兵单弱，请添设九江、京口两镇，以操江、总督文臣协理。并从之。而得功等方各拥兵争江北诸郡；杰围扬州，纵兵大掠，且欲渡江而南。可法乃奏设督师于扬州，节制诸将。
马士英以麾下兵至江干,上疏劝进。丙甲，召士英入京。戊戌，群臣劝进至再三笺，王乃许之。
己亥，可法自请督师江北，诏以便宜行事，各镇并听节制。抚宁侯朱国弼请裁漕镇，从之。召兵部尚书张国维以原官回部，佐理戎政。召前刑部尚书徐石麒为都察院右都御史。以□□□□郑鸿逵为后军都督府署都督佥事，充总兵官，镇守九江等处地方；□□□□黄蜚以原官镇守京口等处地方。以韩赞周为司礼监秉笔太监。
壬寅，王即皇帝位，大赦天下；以明年为弘光元年。在京文武各官普加一级，无级可加者进勋阶一级，并给新衔诰命。在外督抚监司守令，并依见任官衔给与诰命。在籍阁臣及六部堂上官，年六十以上者存问，其遣配及闲住者并复原官。三品以下先行释罪，分别酌用。其北直隶、山东、河南、山西、陕西、辽东等处文武官生义不从贼在南者，文官察明起用，生员赴礼部报名取印结寄应天府学考试；武官指挥千百户等赴兵部察验，附在京各卫寄俸。弘光元年粮免十分之一；北直隶、山西、陕西全免五年，山东、河南全免三年，江北、湖广免十分之五，四川免十分之三。以卢九德为司礼监秉笔太监，提督京营。癸卯，以马士英掌兵部事，仍入阁办事；以礼部右侍郎顾锡畴为礼部尚书兼翰林院侍读学士。分应天、苏松为二巡抚。以太常寺少卿左懋第为都察院右佥都御史，巡抚应、安、徽、宁、池、太、广德等处地方，提督军务兼理粮储。甲辰，以忻城伯赵之龙总督京营戎政。以前都察院右佥都御史田仰巡抚淮、扬等处地方，提督军务兼理海防。进封黄得功为靖南侯、左良玉为宁南侯，仍各荫一子锦衣卫千户世袭；封高杰为兴平伯、刘泽清为东平伯、刘良佐为广昌伯。加马士英太子太保，荫一子锦衣卫指挥佥事世袭。乙巳，以大理寺左寺丞祁彪佳为都察院右佥都御史，巡抚苏松等处地方，总督粮储、提督军务。禁北来逃官不许入京。丁未，可法出京督师，给银二十万两。密谕参将王之纲等迎母妃于江北郭家寨。
李自成遣伪制将军董学礼等率兵南下，至宿迁；己酉，总督漕运巡抚凤阳等处地方都察院右佥都御史路振飞遣兵击败之，擒其伪防御使武愫。
张慎言荐前东阁大学士遣戌吴甡，命召之。庚戌朝，刘孔昭廷讦慎言荐误国罪臣，且定策时有二心；声色俱厉。御史王孙蕃等亦劾孔昭，交争于上前。上谕之，乃退。明日，孔昭具疏论劾，慎言乞罢；上两解之。弘图、曰广各上疏乞罢，不许。以万元吉为太仆寺少卿，监江北军。命御史周一敬护送潞王于杭州居住。设勇卫营，以御马监太监李国辅监督。
壬子，进魏国公徐弘基、南和伯方一元、诚意伯刘孔昭、抚宁侯失国弼、安远侯柳祚昌、灵璧侯汤国祚、东宁伯焦梦熊、成安伯郭祚永各官衔二级，岁加禄米五十石；弘基仍进左柱国。赐韩赞周荫弟侄二人、卢九德一人锦衣卫指挥佥事世袭，仍赐蟒衣及银。癸丑，可法奏先帝已封刘泽清伯爵，命加荫一子锦衣卫正千户世袭。甲寅，遣督师大学士史可法祭告祖陵、皇陵，宁南侯左良玉祭告显陵。
先是，贼陷京师，定远总兵官平西伯吴三桂降于清，引之入关，大败自成于一片石，自成走西安；清乃伪称太子，与三桂合军入京。及至，则清九王也；遂据京师，为先帝发丧，传檄河北、山东皆下之。而道路相传以为三桂借兵克复，又言巡抚辽东都察院右副都御史黎玉田与三桂合谋。德州生员谢陛杀贼所署伪防御使吴征文，奉香河知县宗室帅锨为济王，率士民城守；而傅以为前东阁大学士谢升及前御史卢世水，于是可法以闻。己卯，封三桂蓟国公世袭，命发银五万两、漕米十万石馈之。
太常寺少卿李沾劾吏部左侍郎吕大器定策时怀二心。上曰：『朕遭时不造，痛深君父，何心大宝？直以宗社攸关，勉承重任。当日效忠定策诸臣，朕已鉴知，余不必深求』。大器乞罢，不许。
六月庚申，以福府千户常应俊为中军都督府左都督。壬戌，上大行皇帝谥曰「绍天绎道、刚明恪俭、揆文奋武、敦仁懋孝烈皇帝」，庙号「思宗」；大行皇后谥曰「孝节卢肃、渊恭庄毅、奉天靖圣烈皇后」（「思」字，大学士弘图所拟也）。以都督同知杨振宗充总兵官，镇守安庆。癸亥，以右军都督府都督佥事赵光远为都督同知，充总兵官，提督四川、陕西军务。光远时镇守汉中，命未至，已降于贼。甲子，工部尚书程注致仕。丙寅，吏部尚书张慎言致仕。